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  1. 1
    Initial simulation coordinates.

    Initial simulation coordinates. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  2. 2
    Protein conformational dynamics induced by presence of a lipid membrane.

    Protein conformational dynamics induced by presence of a lipid membrane. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  3. 3
    Coulomb (electrostatic), Lennard-Jones (hydrophobic), and total interaction energy of interacting monomer helices in each model.

    Coulomb (electrostatic), Lennard-Jones (hydrophobic), and total interaction energy of interacting monomer helices in each model. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  4. 4
    Description of systems studied.

    Description of systems studied. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  5. 5
    Distance of each amino acid from the average position of phosphorus atoms in the contacting membrane leaflet in the <i>Surface</i> systems.

    Distance of each amino acid from the average position of phosphorus atoms in the contacting membrane leaflet in the <i>Surface</i> systems. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  6. 6
    Root mean square deviation measurements of monomers.

    Root mean square deviation measurements of monomers. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  7. 7
    Residue contact comparison with reference dimer structure.

    Residue contact comparison with reference dimer structure. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  8. 8
    Energetics of protein interactions.

    Energetics of protein interactions. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  9. 9
    Correlation of protein and lipid motions in the <i>Surface</i> model.

    Correlation of protein and lipid motions in the <i>Surface</i> model. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  10. 10
    Contact maps of residues during the last half of trajectory (200 ns in <i>Sep</i> and 500 ns in <i>Surface</i> model), based on a cutoff of 14 Å.

    Contact maps of residues during the last half of trajectory (200 ns in <i>Sep</i> and 500 ns in <i>Surface</i> model), based on a cutoff of 14 Å. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  11. 11
    Deviations of the <i>Bound</i> model protein dimer conformation from the reference crystal structure of the channel (PDBID: 2M6X).

    Deviations of the <i>Bound</i> model protein dimer conformation from the reference crystal structure of the channel (PDBID: 2M6X). di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  12. 12
    Surface replica 4 structural evaluation.

    Surface replica 4 structural evaluation. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  13. 13
    List of protein residues and selected atoms to define the tilt angle vectors.

    List of protein residues and selected atoms to define the tilt angle vectors. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  14. 14
    Tilt angle conformational landscapes of residues involved in 1-to-1 helix contacts during the last 500 ns of trajectory in the <i>Surface</i> model.

    Tilt angle conformational landscapes of residues involved in 1-to-1 helix contacts during the last 500 ns of trajectory in the <i>Surface</i> model. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  15. 15
    Tilt angle conformational landscapes of residues involved in 1-to-1 helix contacts during the last 200 ns of trajectory in the <i>Sep</i> model.

    Tilt angle conformational landscapes of residues involved in 1-to-1 helix contacts during the last 200 ns of trajectory in the <i>Sep</i> model. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  16. 16
    Protein-lipid dynamic cross correlation maps for <i>Surface</i> replicas 2 and 4 during the entire trajectory.

    Protein-lipid dynamic cross correlation maps for <i>Surface</i> replicas 2 and 4 during the entire trajectory. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  17. 17
    Initial positioning of monomers in replicas 1, 2, 3 and 4 of <i>Surface</i> model.

    Initial positioning of monomers in replicas 1, 2, 3 and 4 of <i>Surface</i> model. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  18. 18
    RMSF per residue in individual p7 monomers for each <i>Sep</i> and <i>Surface</i> model replicas.

    RMSF per residue in individual p7 monomers for each <i>Sep</i> and <i>Surface</i> model replicas. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  19. 19
    Protein-lipid interactions in the <i>Surface</i> model.

    Protein-lipid interactions in the <i>Surface</i> model. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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  20. 20
    Suggested mechanism of p7 dimerization at the ER membrane surface, based on results from this study.

    Suggested mechanism of p7 dimerization at the ER membrane surface, based on results from this study. di Oluwatoyin Campbell (14392137)

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