Gene cluster and characterisation of <i>ChuaHNL</i> and its paralogues.

Gene cluster and characterisation of <i>ChuaHNL</i> and its paralogues.

<p>(A) <i>ChuaHNL</i> and its paralogue cluster on the <i>C. hualienensis</i> genome and synteny among Polydesmida millipedes. (B) Phylogenetic tree and catalytic residues, HNL activity, and gene expression (TMM-normalised reads counts) of <i>ChuaHNL</i> and...

Mô tả đầy đủ

Đã lưu trong:

Chi tiết về thư mục
Tác giả chính:	Takuya Yamaguchi (4543105) (author)
Tác giả khác:	Yasuhisa Asano (727606) (author)
Được phát hành:	2025
Những chủ đề:	Biochemistry Evolutionary Biology Ecology Plant Biology Virology Biological Sciences not elsewhere classified Chemical Sciences not elsewhere classified subsequently converting aldoxime natural defensive chemicals indicating sequential duplication catalyse aldoxime dehydration div >< p cyanogenic millipedes evolved chamberlinius hualienensis </ hualienensis </ r </ typically lineage related enzymes plant lineages plant kingdoms paralogous genes millipedes demonstrates mechanisms underlying hydroxynitrile lyase hydrogen cyanide giving rise enzymes independently dependent monooxygenase deeper understanding cytochrome p450 complete set coding genes biological characterisation >)- mandelonitrile
Các nhãn:	Thêm thẻ Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!

Những quyển sách tương tự

(<i>R</i>)-mandelonitrile synthetic reaction catalyzed by CHUA_005138 (ChuaHNL), CHUA_005137, and CHUA_005136.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Heterologous production of ChuaHNL and its paralogous proteins in <i>Pichia pastoris.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Amino acid sequence alignment of ChuaHNL and its paralogous proteins.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Purification of N-terminal His-tagged ChuaHNL (CHUA_005138) from 1.5 L of <i>Pichia pastoris</i> culture supernatant.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Amino acid sequence identity matrix of ChuaHNL and its paralogous proteins.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Substrate saturation curves for CHUA_005138 (ChuaHNL), CHUA_005137, and CHUA_005136 with (<i>R,S</i>)-mandelonitrile (mandelonitrile cleavage reaction) (A) or benzaldehyde ((<i>R</i>)-mandelonitrile synthetic reaction) (B).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Characterization of CYP4GL4 (CHUA_008368) and CYP30008A2 (CHUA_014123) catalyzing dehydration of (<i>E/Z</i>)-phenylacetaldoxime (PAOx) into phenylacetonitrile.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Amino acid sequence alignment (A) and amino acid sequence identity (B) of CHUA_003298 (ChuaMOxS) from <i>Chamberlinius hualienensis</i>, Hho_019011 from <i>Helicorthomorpha holstii</i>, and Nno_033811 from <i>Niponia nodulosa.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Formation of phenylacetonitrile (PAN) from (<i>E/Z</i>)-phenylacetaldoxime by yeast harboring CHUA_008368 (CYP4GL4) and CHUA_014123 (CYP30008A2).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Purification of N-terminal His-tagged CHUA_005136 from 1.5 L of <i>Pichia pastoris</i> culture supernatant.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Purification of N-terminal His-tagged CHUA_005137 from 1.5 L of <i>Pichia pastoris</i> culture supernatant.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Detection of aromatic amino acids-derived aldoximes after the culture of <i>Escherichia coli</i> harboring millipede aldoxime synthase (MOxS, CHUA_003298).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Three dimensional structures of hydroxynitrile lyase (HNL) from millipede, plant, and microorganism.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Amino acid sequence alignment (A) and amino acid sequence identity (B) of CHUA_008368 (CYP4GL4) from <i>Chamberlinius hualienensis</i>, Hho_020879 from <i>Helicorthomorpha holstii.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Substrate specificity of CYP4GL4 (CHUA_008368) and CYP30008A2 (CHUA_014123) toward aromatic aldoximes.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Amino acid sequence alignment (A) and and amino acid sequence identity (B) of CHUA_014123 (CYP30008A2) from <i>Chamberlinius hualienensis</i> and its orthorogous proteins, Hho_011653 from <i>Helicorthomorpha holstii</i> and Nno_033394 from <i>Niponia nodulosa.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Body weight and accumulation of (<i>R</i>)-mandelonitrile in <i>Chamberlinius hualienensis.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Identification of (<i>R</i>)-mandelonitrile biosynthetic enzymes from <i>C. hualienensis.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

<i>C. hualienensis</i> genome annotation.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Assembly and annotation statistics of <i>Chamberlinius hualienensis</i> genome.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Comparison of phenylacetonitrile (PAN) metabolizing activity of <i>Saccharomyces cerevisiae</i> ChCR11 and INVSc1 expressing <i>CYP3201B1.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

TMM normalized read counts of (<i>R</i>)-mandelonitrile biosynthetic genes.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Characteristics of flavin-dependent monooxygenases (FMOs) from <i>Chamberlinius hualienensis.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Schematic overview of cyanogenesis in <i>Chamberlinius hualienensis</i> and cyanohydrin biosynthesis in millipedes, insects, and plants.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Identification of phenylacetaldoxime (PAOx)-producing flavin dependent monooxygenase from <i>Chamberlinius hualienensis.</i>
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

GenomeScope plot of the 21-mer content within the <i>C. hualienensis</i> genome.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Overview of the processing pipeline used for the assembly of the <i>Chamberlinius hualienensis genome</i> (see materials and methods for detail).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Amino acid sequence alignment (A) and sequence identity matrix (B) of <i>Chamberliniensis hualienensis</i> flavin-dependent monooxygenases.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Distribution of cyanogenesis-related enzymes in millipedes.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Numerical data underlying Figs 3, 4E, S4, S8, S10, S12, S13,
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

TMM normalized read counts of flavin-dependent monooxygenases (FMOs).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

RNA-seq for gene expression analysis.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

RNA-seq for gene annotation.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

TE contents of millipede and centipede.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Shotgun sequencing summary statistics (PacBio).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Shotgun sequencing summary statistics (Illumina).
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Flavin-dependent monooxygenases in myriapods and other species.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Phylogenetic tree of cytochrome P450s.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Phylogenetic tree of millipede HNLs, their paralogous proteins, and lipocalins from animals (arthropoda and chordata), plants, and bacteria.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Correlations of genome sizes and TE contents among millipedes and centipedes.
Bằng: Takuya Yamaguchi (4543105)
Được phát hành: (2025)

Cannot write session to /tmp/vufind_sessions/sess_rh6hmn7fqlu9j0ctdh484a425o