Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTP vs SwissProt

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTP vs SwissProt

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTP vs SwissProt<p></p>

محفوظ في:

التفاصيل البيبلوغرافية
المؤلف الرئيسي:	Franco Liberati (18187333) (author)
منشور في:	2024
الموضوعات:	Genomics and transcriptomics blast annotations
الوسوم:	إضافة وسم لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!

مواد مشابهة

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTX vs SwissProt
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTP vs NR
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTP vs TrEMBL
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTX vs NR
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) BLASTX vs TrEMBL
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

BLASTP vs SwissProt
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

BLASTX vs SwissProt
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Contracaecum osculatum (s.s.) Eggnog output
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) Corset output (Filtered)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) Predicted ORFs (Cds)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) Predicted ORFs (Proteins)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) Orthogroups (OrthoFinder)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) CD-HIT-est output (Filtered)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) Raw quality scores (FastQC)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) - rnaSPAdes RNA-seq de novo trascrittoma assemblaggio
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Contracaecum osculatum (s.s.) Trimmed quality scores (FastQC)
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

BLASTP vs NR
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

BLASTP vs TrEMBL
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Nematostella vs Zebrafish and Amphioxus vs Nematostella BLAST
حسب: Iryna Kozmikova (22819901)
منشور في: (2025)

Poryzae.vcf.gz
حسب: Mark Farman (11615038)
منشور في: (2025)

Swissprot annotation
حسب: Chongyi Jiang (20987126)
منشور في: (2025)

Anisakis pegreffi Homology Annotation
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

ZAMMITII - Eggnog output
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Datafile 5. Assembly Accession
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Zebra60Epiboly vs Nematostella24hr SAMap
حسب: Iryna Kozmikova (22819901)
منشور في: (2025)

Ansakis Pegreffi EggNog result on trascritpome ORFs
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Table 1_Comprehensive genome analysis of Streptomyces caeruleatus S14 isolated from rice rhizosphere.doc
حسب: Sucharita Mohapatra (20936708)
منشور في: (2025)

Table 2_Comprehensive genome analysis of Streptomyces caeruleatus S14 isolated from rice rhizosphere.xlsx
حسب: Sucharita Mohapatra (20936708)
منشور في: (2025)

BLASTX vs NR
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

BLASTX vs TrEMBL
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Swiss-prot annotation information table-transcriptome functional annotation.
حسب: Qing Xie (104232)
منشور في: (2025)

<b>Underlying data for '</b><b>Computational prediction of a phage cocktail active against multidrug-resistant bacteria'</b>
حسب: Rabia Nawaz (19715521)
منشور في: (2024)

Summary results
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2024)

Figure 5. Orthogroup Analysis in Chlorophyta.
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Figure 4 A phylogenomic tree was constructed to depict the evolutionary relationships among the analyzed species. This tree was based on single-copy orthologous genes and rooted using Talaromyces marneffei, and Dictyostelium discoideum AX4 as outgroups. The root tree for species was based on single-copy orthologs, generated with Orthofinder and IQTree. Bootstrap values are also reported.
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Fig.6. Orthogroup Analysis in Stramenopiles and Alveolata
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Figure S1
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Figure 2B. Number of species with genomes whose gene completeness level is as follows: greater than or equal to 95% (green bar), between 90% and 95% (blue bar), between 85% and 90% (orange bar), and between 80% and 85% (red bar). In the legend is reported the degree of gene completeness of genome assembly for each microalga species investigated with BUSCO.
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Figure 2A. Species of microalgae with genomes whose level of gene completeness is at least greater than or equal to 80%
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Figure 3A Results of BUSCO Chlorophyta completeness assessments for quality control of genomic data for the microalgae filtered. Bar graphs produced with the BUSCO plotting tool show the proportions classified as complete (C, blue), fragmented (F, yellow) and missing (M, red).
حسب: Franco Liberati (18187333)
منشور في: (2025)

Cannot write session to /tmp/vufind_sessions/sess_8o6nlre171jp1agh07e1s466ct