Protein-lipid dynamic cross correlation maps for <i>Surface</i> replicas 2 and 4 during the entire trajectory.

Protein-lipid dynamic cross correlation maps for <i>Surface</i> replicas 2 and 4 during the entire trajectory.

<p>Negative and positive correlations represented in blue and red respectively.</p> <p>(TIFF)</p>

Đã lưu trong:

Chi tiết về thư mục
Tác giả chính:	Oluwatoyin Campbell (14392137) (author)
Tác giả khác:	Dina Dahhan (22683620) (author), Viviana Monje (2056069) (author)
Được phát hành:	2025
Những chủ đề:	Biophysics Biochemistry Cell Biology Genetics Molecular Biology Biotechnology Cancer Biological Sciences not elsewhere classified Chemical Sciences not elsewhere classified Physical Sciences not elsewhere classified Information Systems not elsewhere classified process may help complex transmembrane topology comparing dimer interactions aqueous solution versus promote p7 oligomerization protein residue alignment p7 dimers driven alignment underlie health study demonstrates particularly involving often composed molecular mechanisms key residues hydrophobic contacts hydrogen bonding first helix explain assembly dynamic contributors channel assembly
Các nhãn:	Thêm thẻ Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!

Những quyển sách tương tự

Initial positioning of monomers in replicas 1, 2, 3 and 4 of <i>Surface</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Protein-lipid interactions in the <i>Surface</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

RMSF per residue in individual p7 monomers for each <i>Sep</i> and <i>Surface</i> model replicas.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Correlation of protein and lipid motions in the <i>Surface</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Surface replica 4 structural evaluation.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Frequency of hydrogen bonds between individual residues and lipid species during the last half of trajectory (500 ns) in the <i>Surface</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Protein conformational dynamics induced by presence of a lipid membrane.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Contact maps of residues during the last half of trajectory (200 ns in <i>Sep</i> and 500 ns in <i>Surface</i> model), based on a cutoff of 14 Å.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Distance of each amino acid from the average position of phosphorus atoms in the contacting membrane leaflet in the <i>Surface</i> systems.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Snapshot showing cholesterol contacts with the N-terminus of p2 and H2 and H3 of p1 in the <i>Surface</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Deviations of the <i>Bound</i> model protein dimer conformation from the reference crystal structure of the channel (PDBID: 2M6X).
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Tilt angle conformational landscapes of residues involved in 1-to-1 helix contacts during the last 500 ns of trajectory in the <i>Surface</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Tilt angle conformational landscapes of residues involved in 1-to-1 helix contacts during the last 200 ns of trajectory in the <i>Sep</i> model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Suggested mechanism of p7 dimerization at the ER membrane surface, based on results from this study.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Energetics of protein interactions.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Residue contact comparison with reference dimer structure.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Initial simulation coordinates.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Coulomb (electrostatic), Lennard-Jones (hydrophobic), and total interaction energy of interacting monomer helices in each model.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Root mean square deviation measurements of monomers.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

List of protein residues and selected atoms to define the tilt angle vectors.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Description of systems studied.
Bằng: Oluwatoyin Campbell (14392137)
Được phát hành: (2025)

Structural Evidence of Interanionic Hydrogen Bonding in Phosphoric Acid Solutions
Bằng: Pyeongeun Kim (9509954)
Được phát hành: (2025)

Lipid residency distributions during coarse-grained simulations of YbbAP.
Bằng: Martin B. L. McAndrew (22683641)
Được phát hành: (2025)

A Series of Experiments on Criticality and Reflector Reactivity Worth in FCA-XXIII-1 and FCA-XXIV-1 Assemblies Simulating a Small Fast Reactor with a Thick Stainless Steel Reflector
Bằng: Masahiro Fukushima (2249263)
Được phát hành: (2025)

Transfer task (pre- and post-test) design and information alignment.
Bằng: Denise Moerel (9080849)
Được phát hành: (2025)

The contribution of shared rules to neural information alignment, for the first (A) and second (B) experiment half.
Bằng: Denise Moerel (9080849)
Được phát hành: (2025)

The time-course of information alignment, split by first and second experiment half.
Bằng: Denise Moerel (9080849)
Được phát hành: (2025)

The time-course of information alignment.
Bằng: Denise Moerel (9080849)
Được phát hành: (2025)

Information alignment between the two individuals in each pair.
Bằng: Denise Moerel (9080849)
Được phát hành: (2025)

Stimuli, experiment procedure, and behavioral results.
Bằng: Denise Moerel (9080849)
Được phát hành: (2025)

Molecular dynamics simulations of YbbAP suggest the periplasmic-side pocket is a lipid-binding site.
Bằng: Martin B. L. McAndrew (22683641)
Được phát hành: (2025)

Atomistic molecular dynamics simulation showing partial extraction of a lipid from the bilayer by YbbAP.
Bằng: Martin B. L. McAndrew (22683641)
Được phát hành: (2025)

Human Values, Purpose & Meaning 2025 (Dataset)
Bằng: Human Clarity Institute (22464229)
Được phát hành: (2025)

Ligand Binding to the Membrane-Distal Domain of the Met Receptor Induces Dimerization at the Membrane-Proximal Domain
Bằng: Neval Yilmaz (1544557)
Được phát hành: (2025)

Ligand Binding to the Membrane-Distal Domain of the Met Receptor Induces Dimerization at the Membrane-Proximal Domain
Bằng: Neval Yilmaz (1544557)
Được phát hành: (2025)

Ligand Binding to the Membrane-Distal Domain of the Met Receptor Induces Dimerization at the Membrane-Proximal Domain
Bằng: Neval Yilmaz (1544557)
Được phát hành: (2025)

Ligand Binding to the Membrane-Distal Domain of the Met Receptor Induces Dimerization at the Membrane-Proximal Domain
Bằng: Neval Yilmaz (1544557)
Được phát hành: (2025)

Ligand Binding to the Membrane-Distal Domain of the Met Receptor Induces Dimerization at the Membrane-Proximal Domain
Bằng: Neval Yilmaz (1544557)
Được phát hành: (2025)

Individual memory performance was predicted by a subset of iEEG signal components.
Bằng: Adam J. O. Dede (11554007)
Được phát hành: (2025)

Characteristics of patients infected with norovirus GII.
Bằng: Leera Kittigul (22676501)
Được phát hành: (2025)

Cannot write session to /tmp/vufind_sessions/sess_k0mctnpseaje5j442b7m4ob62n