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1
Impact of different substitution rate category parameters on cluster inference in different mixture datasets.
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August Guang (9975678)
Publié 2025
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Rates of different base frequencies from different mixture datasets.
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August Guang (9975678)
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Rates of different gamma relative rate categories from different mixture datasets.
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Principle Coordinates Analysis (PCoA) projected onto 2 dimensions between pol-wgs mixtures and nFL genome, subset dataset
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August Guang (9975678)
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Proportion of clusters recovered between different mixtures of pol and wgs sequences and all wgs based on overlap coefficient, full dataset.
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August Guang (9975678)
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Principle Coordinates Analysis (PCoA) projected onto 2 dimensions between pol-wgs mixtures and nFL genome, full dataset
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Proportion of clusters recovered between different mixtures of pol and wgs sequences and all wgs based on overlap coefficient, subset dataset.
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Phylogenetic distance between partial pol-wgs mixtures and nFL genome for subset dataset.
par
August Guang (9975678)
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9
Adjusted mutual information (AMI) boxplot between phylogenetic clustering of different mixtures of pol and wgs sequences and all wgs, full dataset.
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August Guang (9975678)
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Phylogenetic distance between partial pol-wgs mixtures and nFL genome for full dataset.
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Adjusted mutual information (AMI) boxplot between phylogenetic clustering of different mixtures of pol and wgs sequences and all wgs, subset dataset.
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August Guang (9975678)
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Workflow for alignment dataset generation and phylogenetic analysis.
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August Guang (9975678)
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Scatter and line plots of cluster number and mean cluster size as wgs percentage in mixture increases, subset dataset.
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August Guang (9975678)
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Scatter and line plots of cluster number and mean cluster size as wgs percentage in mixture increases, full dataset.
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August Guang (9975678)
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